단일 세포 유전체 시퀀싱 시장 규모 및 점유율 분석 – 성장 동향 및 전망 (2026-2031년)

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단일 세포 유전체 시퀀싱 시장 개요 (2026-2031)

단일 세포 유전체 시퀀싱 시장은 2025년 38억 2천만 달러에서 2026년 43억 9천만 달러로 성장했으며, 2031년에는 88억 달러에 도달하여 예측 기간(2026-2031) 동안 연평균 성장률(CAGR) 14.94%를 기록할 것으로 전망됩니다. 이러한 성장은 정밀 종양학 워크플로우의 급속한 발전, 염기당 시퀀싱 비용의 급격한 하락, 그리고 임상 등급의 데이터 품질을 제공하는 화학 기술 개선에 힘입은 바가 큽니다. 소모품 수요는 독점적인 미세유체 카트리지와 바코드 라이브러리 키트가 매 실행마다 재주문되어야 하므로 꾸준히 유지되고 있으며, 장비 부문은 벤치탑 장독(long-read) 시스템이 중소 규모 연구실의 진입 장벽을 낮추면서 자본 재투자가 활발히 이루어질 것으로 예상됩니다. 특히 미국 FDA가 2024년 유전체 편집 세포 치료제 특성화를 위한 직교 단일 세포 분석법을 권고하는 지침을 발표하는 등 규제 환경도 시장 성장을 뒷받침하고 있습니다. 경쟁 우위는 이제 엔드투엔드 워크플로우 소유권에 달려 있으며, 공급업체들은 병원 연구실의 조달 주기를 단축하기 위해 분리, 증폭, 시퀀싱, 생물정보학을 단일 패키지로 묶는 데 주력하고 있습니다.

시장 성장 동력

1. 정밀 종양학 및 미세잔존질환(MRD) 워크플로우 성장: 단일 세포 수준의 변이 분석은 0.01% 미만의 악성 클론을 감지하는 민감도를 제공하여 기존 대량 시퀀싱의 한계를 극복합니다. 다나-파버 암 연구소와 메모리얼 슬론 케터링 암 센터는 2024년 급성 림프구성 백혈병 환자 코호트에서 클론 진화를 추적하기 위해 크로미움(Chromium) 플랫폼을 도입하여 임상적 유용성을 입증했습니다. 2024년 10월 FDA의 Oncomine Dx 보충 패널 승인은 동반 진단에서 단일 세포 데이터의 정당성을 확보하여 보험 상환 및 제약 임상 시험 채택을 가속화하고 있습니다. MRD의 조기 발견은 재발 관련 비용을 절감하고 종양학 약물 개발 기간을 단축하여 단일 세포 유전체 시퀀싱 시장의 지출 모멘텀을 강화합니다.

2. 단일 세포 WGA(Whole Genome Amplification) 화학 기술 발전으로 데이터 품질 향상: 과거에는 대립유전자 탈락(allelic dropout)과 GC 편향(GC bias)이 임상 적용을 제한했습니다. 타카라 바이오(Takara Bio)의 2024년 PicoPLEX 업데이트는 30배 깊이에서 95% 이상의 유전체 커버리지를 달성하여 대량 시퀀싱과의 충실도 격차를 좁혔습니다. 바이오스크립(BioSkryb)의 프라이머리 템플릿 지향 증폭(PTDA) 기술은 기존 MDA 키트에 비해 잘못된 구조적 변이 호출을 60% 감소시켰습니다. 규제 당국은 이제 제출 자료에서 균일성 지표를 참조하며, 낮은 편향 화학 기술을 문서화하는 공급업체를 선호하여 시장 성장을 더욱 촉진하고 있습니다.

3. 시퀀싱 비용 하락 및 고처리량 플랫폼 가용성 증가: NHGRI(미국 국립인간유전체연구소)는 2024년 전체 유전체 시퀀싱 가격이 600달러 미만으로 하락했다고 보고했습니다. 일루미나(Illumina)의 NovaSeq X Plus는 런당 16테라베이스를 기가베이스당 2.40달러에 처리할 수 있습니다. 팩바이오(PacBio)의 169,000달러짜리 베가(Vega) 벤치탑 시스템과 옥스포드 나노포어(Oxford Nanopore)의 345달러 미만 프로메티온 플러스(PromethION Plus) 유전체 타겟은 장독 시퀀싱을 병원 예산 범위 내로 가져왔습니다. 이러한 가격 하락은 단일 세포 유전체 시퀀싱 시장을 엘리트 핵심 시설을 넘어 확장시키고 있습니다.

4. 세포 아틀라스 및 바이오뱅크 이니셔티브 확장: 휴먼 셀 아틀라스(Human Cell Atlas)는 2024년 1,350만 개의 참조 프로파일을 발표하여 연구자들에게 비교 분석을 위한 기준 변이 지도를 제공했습니다. 타불라 사피엔스(Tabula Sapiens)는 24개 장기에 걸쳐 50만 개의 단일 세포 유전체를 분류하여 조직 특이적 돌연변이 시그니처를 밝혀냈습니다. 영국, 일본, 한국의 국립 바이오뱅크는 이제 새로운 샘플이 단일 세포 분석에 적합하도록 보장하여 연구 비용을 절감하고 시장을 활성화하고 있습니다.

시장 제약 요인

1. 높은 샘플당 비용 및 장비 비용: 샘플당 비용은 500달러에서 2,000달러에 이르며, 주력 시퀀서의 가격은 100만 달러에 달하여 소규모 센터의 도입을 저해합니다. 독점적인 카트리지 설계로 인해 소모품 가격이 여전히 높으며, 클라우드 생물정보학 비용은 샘플당 50~150달러를 추가합니다. 이러한 비용은 단기적으로 시장 성장을 억제하는 요인으로 작용합니다.

2. 복잡한 생물정보학 및 스토리지 부담: 30배 커버리지의 각 단일 세포 유전체는 최대 120기가바이트의 데이터를 생성합니다. Seurat와 같은 오픈 소스 파이프라인은 희소한 전문 지식을 요구하며, EU의 데이터 주권 규정은 경제적인 클라우드 솔루션을 방해합니다. AWS의 레인보우(Rainbow) 파이프라인은 2024년 분석 비용을 120달러 미만으로 낮췄지만, 국경 간 데이터 전송 제약은 보편적인 채택을 어렵게 합니다.

세그먼트 분석

1. 제품 유형별:
* 시약 및 소모품: 2025년 시장 수익의 44.78%를 차지하며, 단일 세포 유전체 시퀀싱 시장에서 반복적인 수익의 핵심임을 보여줍니다. 독점적인 미세유체 카트리지는 모든 실험을 특정 공급업체의 키트에 묶어두어, 장비 설치가 성숙하더라도 예측 가능한 재주문 주기를 만듭니다.
* 장비: 2031년까지 16.89%의 CAGR로 성장할 것으로 예상됩니다. 169,000달러짜리 베가(Vega)와 같은 벤치탑 장독 시스템은 중소 규모 기관이 핵심 시설 시간을 예약하는 대신 장비를 직접 구매할 수 있도록 합니다. 설치 기반 확장은 특히 북미에서 초기 NovaSeq 장비의 감가상각이 임박하면서 교체 수요를 촉발하고 있습니다.

2. 시퀀싱 기술별:
* 단독 시퀀싱(Short-Read): 2025년 단일 세포 유전체 시퀀싱 시장의 66.90%를 차지했으며, NovaSeq 및 NextSeq의 경제성에 힘입었습니다.
* 장독 시퀀싱(Long-Read): 예측 기간 동안 17.88%의 CAGR로 성장하고 있습니다. 이는 단독 시퀀싱이 복잡한 어셈블리 없이는 불가능한 구조 변이 감지 및 일배체형(haplotype) 분석 능력에 의해 주도됩니다. 옥스포드 나노포어의 PromethION Plus는 345달러 미만의 유전체 시퀀싱을 약속하며, 표적 캡처 방법은 전체 유전체 증폭을 제거하여 산전 유전학 및 종양학 분야의 데이터 충실도를 향상시킵니다.

3. 워크플로우 단계별:
* 유전체 분석 및 데이터 해석: 2025년 수익의 68.25%를 차지했으며, 계속해서 수익의 핵심이 될 것입니다. AWS 레인보우와 같은 클라우드 파이프라인은 컴퓨팅 비용을 절감하지만, 검증된 임상 소프트웨어는 위양성률(false-discovery rate)을 낮추는 데 기여하여 프리미엄을 받습니다. 바이오스크립의 PTD 프로토콜과 같은 전체 유전체 증폭의 화학적 혁신은 더 높은 신뢰도의 변이 호출로 직접 이어져 임상 틈새 시장을 확대합니다.

4. 적용 분야별:
* 종양학: 2025년 수익 점유율 39.10%로 선두를 유지했으며, MRD 감지 및 클론 진화 추적에 의해 주도됩니다.
* 면역학 및 감염병: 백신 설계 및 숙주-병원체 연구에서 단일 세포 면역 프로파일링이 주목받으면서 18.05%의 CAGR로 확장될 준비가 되어 있습니다.
* 산전 및 배아 유전학: 비침습적 부모 샘플링 없이 일배체형 분석을 위해 장독 시퀀싱을 활용하여 샘플당 프리미엄 가격을 제공하고 전체 시장 규모를 증가시킵니다.
* 메타게놈학: 배양 실패 시 세포 수준 유전체를 사용하여 항생제를 선택하는 정밀 감염 관리 도구로 부상하고 있습니다.

5. 최종 사용자별:
* 학술 및 연구 기관: 2025년 53.70%의 점유율을 유지했습니다.
* 제약 및 생명공학 기업: FDA의 유전자 편집 치료제에 직교 단일 세포 QC를 포함하도록 권고하는 지침에 따라 17.12%의 CAGR로 더 빠르게 성장할 것으로 예상됩니다. CRO 및 CMO는 배치 출시 규모를 확장하기 위해 자동화된 Tri-Omics 준비를 채택하여 공급업체의 설치 기반을 강화하고 있습니다.

지역 분석

1. 북미: 2025년 수익의 43.70%를 차지했으며, NIH 자금 지원과 MRD의 초기 임상 구현의 혜택을 받았습니다. 2024년 10월 미국 FDA의 Oncomine Dx 내 단일 세포 변이 분석 승인은 진단 기술을 검증하고 병원 조달을 촉진했습니다.
2. 아시아 태평양: 16.72%의 CAGR로 가장 빠르게 성장하는 지역입니다. 중국 지방의 정밀 의학 예산과 일본 제약 회사의 세포 치료제 라인에 단일 세포 QC를 포함하는 추세에 힘입어 성장하고 있습니다.

경쟁 환경

일루미나(Illumina), 10x 지노믹스(10x Genomics), 써모 피셔 사이언티픽(Thermo Fisher Scientific)이 전 세계 수익의 상당 부분을 차지하며, 단일 세포 유전체 시퀀싱 시장은 중간 정도의 집중도를 보입니다. 진행 중인 특허 소송은 지적 재산의 전략적 중요성을 강조하며, 10x 지노믹스는 분할 특허를 방어하고 일루미나는 시퀀싱 화학 기술 경쟁업체와 다투고 있습니다. 수직 통합은 전략을 형성하고 있습니다. 일루미나는 2024년 7월 Fluent BioSciences를 인수하여 상류 라이브러리 준비를 내재화했으며, 바이오스크립과 테칸(Tecan)은 2025년 4월 자동화와 Tri-Omics 화학 기술을 결합했습니다. 클라우드 제공업체는 이제 생물정보학 가치 풀을 주장하며, AWS는 샘플당 120달러 미만의 전체 유전체 분석을 제공하여 해석을 장비 프랜차이즈와 분리하고 있습니다. 틈새 전문 기업들은 미션 바이오(Mission Bio)가 클론성 조혈증에 집중하고 바이오스크립이 희귀 세포를 위한 초저입력 WGA를 제공하는 등 빈 공간을 활용하고 있습니다. 전반적인 차별화는 이제 하드웨어 처리량 단독보다는 워크플로우의 완성도와 소프트웨어의 용이성으로 이동하고 있습니다.

주요 시장 플레이어: QIAGEN, Illumina, Inc., F. Hoffmann-La Roche Ltd., ThermoFisher Scientific, Inc., Standard BioTools (Fluidigm).

최근 산업 동향

* 2025년 4월: 바이오스크립 지노믹스(BioSkryb Genomics)와 테칸(Tecan)이 Tri-Omics 라이브러리 준비 자동화를 위해 파트너십을 맺어 수동 작업 시간을 90분으로 단축했습니다.
* 2025년 3월: 알맥 진단 서비스(Almac Diagnostic Services)가 바이오마커 포트폴리오 확장을 위해 단일 세포 RNA-seq 서비스를 출시했습니다.
* 2025년 2월: 로슈(Roche)가 광범위한 응용 분야를 위한 초고속 실행을 약속하는 시퀀싱-바이-확장(sequencing-by-expansion) 화학 기술을 공개했습니다.

이 보고서는 단일 세포 유전체 시퀀싱 시장에 대한 포괄적인 분석을 제공합니다. 단일 세포 유전체 시퀀싱은 단일 세포 분리, 전유전체 증폭(WGA), 시퀀싱 라이브러리 구축 및 차세대 시퀀서를 이용한 DNA 시퀀싱 과정을 포함합니다. 본 연구는 시장의 정의, 연구 가정, 방법론 및 주요 요약으로 시작하여 시장의 전반적인 이해를 돕습니다.

시장 동인으로는 정밀 종양학 및 미세잔존질환(MRD) 워크플로우 사용 증가, 단일 세포 WGA 화학 기술 발전으로 인한 데이터 품질 향상, 시퀀싱 비용 하락 및 고처리량 플랫폼의 가용성 확대가 있습니다. 또한, 세포 아틀라스 및 바이오뱅크 이니셔티브의 확장, CGT(세포 및 유전자 치료) 워크플로우 및 중개 연구에서의 Tri-Omics 채택 증가, 그리고 표적 장독성 단일 세포 프로토콜의 발전이 시장 성장을 견인하고 있습니다.

반면, 시장 제약 요인으로는 샘플당 및 장비당 높은 비용, 복잡한 생물정보학 및 데이터 저장 부담, 수출/조달 제한으로 인한 플랫폼 제약, 그리고 지적 재산권(IP) 장벽 및 라이선스 제약이 있습니다. 특히, 샘플당 500~2,000 USD, 장비당 100만 USD 이상의 높은 비용은 가격에 민감한 신흥 시장에서의 채택을 제한하는 주요 요인으로 작용합니다.

시장은 다양한 기준으로 세분화됩니다. 제품 유형별로는 시약 및 소모품, 장비, 소프트웨어 및 서비스로 나뉘며, 시퀀싱 기술/플랫폼별로는 단독성 NGS, 장독성, PCR, 마이크로어레이 및 기타 지원 기술로 구분됩니다. 워크플로우 단계별로는 단일 세포 분리 및 분할, 전유전체 증폭 및 라이브러리 준비, 유전체 분석 및 데이터 해석으로 분류됩니다. 응용 분야는 종양학, 면역학 및 감염성 질환, 산전/배아 유전학 및 생식 건강, 신경학 및 체세포 모자이크 현상, 미생물학 및 메타게놈학을 포함합니다. 최종 사용자별로는 학술 및 연구 기관, 제약 및 생명공학 기업, 병원 및 진단 실험실로 구성됩니다. 지리적으로는 북미, 유럽, 아시아-태평양, 중동 및 아프리카, 남미의 주요 지역과 17개국에 대한 시장 규모 및 동향을 다룹니다.

단일 세포 유전체 시퀀싱 시장은 2026년에 43억 9천만 USD 규모에 달할 것으로 예상되며, 2026년부터 2031년까지 연평균 성장률(CAGR) 14.94%를 기록하며 성장할 것으로 전망됩니다. 응용 분야 중에서는 면역학 및 감염성 질환 분야가 2031년까지 18.05%의 CAGR로 가장 빠르게 성장할 것으로 예측됩니다. 기술 측면에서는 장독성 플랫폼이 단일 세포 해상도에서 구조적 변이 및 위상형 일배체형을 해결하는 능력 덕분에 17.88%의 CAGR로 시장 점유율을 확대하고 있습니다. 지역별로는 중국과 일본의 정밀 의학 투자에 힘입어 아시아-태평양 지역이 16.72%의 CAGR로 가장 빠른 성장을 보일 것으로 예상됩니다.

경쟁 환경 분석은 시장 집중도, 시장 점유율 분석 및 Agilent Technologies, Illumina, Oxford Nanopore Technologies, Thermo Fisher Scientific 등 21개 주요 기업의 프로필을 포함합니다. 보고서는 또한 시장 기회와 미래 전망, 그리고 미충족 수요 평가를 통해 시장의 잠재력을 제시합니다.


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1. 서론

  • 1.1 연구 가정 & 시장 정의
  • 1.2 연구 범위

2. 연구 방법론

3. 요약

4. 시장 현황

  • 4.1 시장 개요
  • 4.2 시장 동인
    • 4.2.1 정밀 종양학 및 측정 가능한 잔존 질환(MRD) 워크플로우 사용 증가.
    • 4.2.2 단일 세포 WGA 화학의 발전으로 데이터 품질 향상
    • 4.2.3 시퀀싱 비용 감소 및 고처리량 플랫폼의 가용성.
    • 4.2.4 세포 아틀라스 및 바이오뱅크 이니셔티브 확장
    • 4.2.5 CGT 워크플로우 및 중개 연구에서 Tri-Omics 채택 증가.
    • 4.2.6 표적 장독 단일 세포 프로토콜의 발전
  • 4.3 시장 제약
    • 4.3.1 샘플당 및 장비당 높은 비용.
    • 4.3.2 복잡한 생물정보학 & 저장 부담.
    • 4.3.3 수출/조달 제한으로 인한 플랫폼 제약.
    • 4.3.4 IP 장벽 및 라이선스 제약
  • 4.4 가치 / 공급망 분석
  • 4.5 규제 환경
  • 4.6 기술 전망
  • 4.7 포터의 5가지 경쟁 요인
    • 4.7.1 신규 진입자의 위협
    • 4.7.2 공급업체의 협상력
    • 4.7.3 구매자의 협상력
    • 4.7.4 대체재의 위협
    • 4.7.5 경쟁 강도

5. 시장 규모 및 성장 예측 (가치, USD)

  • 5.1 제품 유형별
    • 5.1.1 시약 및 소모품
    • 5.1.2 기기
    • 5.1.3 소프트웨어 및 서비스
  • 5.2 시퀀싱 기술/플랫폼별
    • 5.2.1 단일 염기 서열 NGS
    • 5.2.2 장일 염기 서열
    • 5.2.3 PCR
    • 5.2.4 마이크로어레이
    • 5.2.5 기타 지원 기술
  • 5.3 워크플로우 단계별
    • 5.3.1 단일 세포 분리 및 분할
    • 5.3.2 전유전체 증폭(WGA) 및 라이브러리 준비
    • 5.3.3 유전체 분석 및 데이터 해석
  • 5.4 애플리케이션별
    • 5.4.1 종양학
    • 5.4.2 면역학 및 감염병
    • 5.4.3 산전/배아 유전학 및 생식 건강
    • 5.4.4 신경학 및 체세포 모자이크 현상
    • 5.4.5 미생물학 및 메타게놈학
  • 5.5 최종 사용자별
    • 5.5.1 학술 및 연구 기관
    • 5.5.2 제약 및 생명공학 기업
    • 5.5.3 병원 및 진단 실험실
  • 5.6 지역별
    • 5.6.1 북미
    • 5.6.1.1 미국
    • 5.6.1.2 캐나다
    • 5.6.1.3 멕시코
    • 5.6.2 유럽
    • 5.6.2.1 독일
    • 5.6.2.2 영국
    • 5.6.2.3 프랑스
    • 5.6.2.4 이탈리아
    • 5.6.2.5 스페인
    • 5.6.2.6 기타 유럽
    • 5.6.3 아시아 태평양
    • 5.6.3.1 중국
    • 5.6.3.2 일본
    • 5.6.3.3 인도
    • 5.6.3.4 호주
    • 5.6.3.5 대한민국
    • 5.6.3.6 기타 아시아 태평양
    • 5.6.4 중동 및 아프리카
    • 5.6.4.1 GCC
    • 5.6.4.2 남아프리카
    • 5.6.4.3 기타 중동 및 아프리카
    • 5.6.5 남미
    • 5.6.5.1 브라질
    • 5.6.5.2 아르헨티나
    • 5.6.5.3 기타 남미

6. 경쟁 환경

  • 6.1 시장 집중도
  • 6.2 시장 점유율 분석
  • 6.3 기업 프로필 (글로벌 개요, 시장 수준 개요, 핵심 부문, 재무, 전략 정보, 시장 순위/점유율, 제품 및 서비스, 최근 개발 포함)
    • 6.3.1 Agilent Technologies
    • 6.3.2 BGI Americas
    • 6.3.3 BGI Group
    • 6.3.4 Bio-Rad Laboratories
    • 6.3.5 BioSkryb Genomics
    • 6.3.6 CD Genomics
    • 6.3.7 Danaher
    • 6.3.8 F. Hoffmann-La Roche AG
    • 6.3.9 Illumina
    • 6.3.10 MGI Tech
    • 6.3.11 Mission Bio
    • 6.3.12 Novogene
    • 6.3.13 Oxford Nanopore Technologies
    • 6.3.14 PacBio (Pacific Biosciences)
    • 6.3.15 Psomagen
    • 6.3.16 QIAGEN
    • 6.3.17 Silicon Biosystems (Ampli1)
    • 6.3.18 Standard BioTools (Fluidigm)
    • 6.3.19 Takara Bio
    • 6.3.20 Thermo Fisher Scientific
    • 6.3.21 Yikon Genomics

7. 시장 기회 및 미래 전망

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***** 참고 정보 *****
단일 세포 유전체 시퀀싱은 개별 세포 하나로부터 전체 유전체 정보를 해독하는 기술을 의미합니다. 기존의 대량 세포 시퀀싱 방식이 수많은 세포의 평균적인 유전체 정보를 제공하는 것과 달리, 단일 세포 유전체 시퀀싱은 세포 집단 내에 존재하는 이질성(heterogeneity)을 밝혀내고, 희귀 세포 집단이나 특정 세포의 돌연변이, 유전체 구조 변화 등을 정밀하게 분석할 수 있도록 합니다. 이는 생명 현상의 근본적인 이해를 심화하고 질병의 발생 및 진행 메커니즘을 규명하는 데 필수적인 정보를 제공합니다.

단일 세포 유전체 시퀀싱의 유형은 크게 세포 분리 방법과 유전체 증폭 및 시퀀싱 방법에 따라 나눌 수 있습니다. 세포 분리 방법으로는 형광 활성 세포 분류기(FACS)를 이용한 정밀한 세포 분리, 미세유체역학(Microfluidics) 기반의 고속 대량 세포 분리(예: 10x Genomics Chromium 시스템), 그리고 수동 피펫팅을 통한 희귀 세포 분리 등이 있습니다. 분리된 단일 세포의 극미량 DNA를 시퀀싱 가능한 수준으로 증폭하기 위해 다중 치환 증폭(MDA, Multiple Displacement Amplification), DOP-PCR(Degenerate Oligonucleotide Primed PCR), MALBAC(Multiple Annealing and Looping Based Amplification Cycles) 등 다양한 전유전체 증폭(WGA, Whole Genome Amplification) 기술이 활용됩니다. 이들 기술은 증폭 효율, 균일성, 오류율 등에서 차이를 보이며, 연구 목적에 따라 적합한 방법이 선택됩니다. 증폭된 DNA는 주로 일루미나(Illumina)와 같은 차세대 시퀀싱(NGS) 플랫폼을 통해 해독됩니다.

이 기술은 다양한 분야에서 혁신적인 활용 가능성을 보여주고 있습니다. 암 연구에서는 종양 내 이질성, 전이 메커니즘, 약물 내성 발생 원인 등을 단일 세포 수준에서 분석하여 맞춤형 치료 전략 수립에 기여합니다. 발생 생물학 분야에서는 세포 계통 추적, 배아 발달 과정에서의 유전체 변화, 세포 분화 경로 등을 규명하는 데 활용됩니다. 신경과학에서는 뇌 세포의 다양성과 신경 질환의 유전적 원인을 탐색하며, 면역학에서는 면역 세포의 기능적 다양성과 감염 및 자가면역 질환에서의 역할을 이해하는 데 중요한 도구로 사용됩니다. 또한, 생식 의학에서는 착상 전 유전 진단(PGD)이나 비침습 산전 검사(NIPT)의 정확도를 높이는 데 기여할 잠재력을 가지고 있습니다.

단일 세포 유전체 시퀀싱과 관련된 주요 기술로는 단일 세포 전사체 시퀀싱(scRNA-seq)이 가장 대표적입니다. 이는 단일 세포의 유전자 발현 패턴을 분석하여 세포 유형 분류 및 기능 연구에 활용되며, 유전체 시퀀싱과 함께 다중 오믹스(multi-omics) 분석을 통해 세포의 유전적 특성과 기능적 상태를 통합적으로 이해하는 데 기여합니다. 또한, 단일 세포 후성유전체 시퀀싱(scATAC-seq, scMethyl-seq)은 염색질 접근성이나 DNA 메틸화 패턴을 분석하여 유전자 발현 조절 메커니즘을 밝히는 데 사용됩니다. 미세유체역학 기술은 단일 세포의 효율적인 분리 및 라이브러리 준비에 필수적이며, 방대한 데이터의 분석과 해석을 위한 첨단 생물정보학 및 통계학적 방법론의 개발 또한 중요한 관련 기술입니다.

시장 배경을 살펴보면, 정밀 의학 및 개인 맞춤형 치료에 대한 수요 증가, 질병 메커니즘에 대한 심층적인 이해 필요성 증대, 그리고 시퀀싱 비용 하락 및 기술 발전이 단일 세포 유전체 시퀀싱 시장의 성장을 견인하고 있습니다. 일루미나, 10x Genomics, BGI, 써모 피셔 사이언티픽(Thermo Fisher Scientific), 타카라 바이오(Takara Bio) 등 여러 글로벌 기업들이 관련 장비, 시약, 분석 솔루션을 제공하며 시장을 주도하고 있습니다. 그러나 여전히 높은 비용, 복잡한 실험 과정, 데이터 분석의 어려움, 그리고 증폭 과정에서 발생하는 오류 및 편향은 해결해야 할 과제로 남아 있습니다.

미래 전망은 매우 밝습니다. 기술 발전은 더욱 높은 처리량과 낮은 비용을 가능하게 하여 단일 세포 유전체 시퀀싱의 접근성을 높일 것입니다. 단일 세포 수준에서 유전체, 전사체, 후성유전체, 단백체 등 다양한 오믹스 데이터를 동시에 분석하는 다중 오믹스 통합 기술이 더욱 발전할 것이며, 이는 세포의 복잡한 생물학적 상태를 총체적으로 이해하는 데 기여할 것입니다. 또한, 조직 내 세포의 공간적 위치 정보를 보존하면서 유전체 정보를 분석하는 공간 유전체학(spatial genomics) 기술과의 융합을 통해 세포 간 상호작용 및 조직 미세 환경의 역할을 규명하는 연구가 활발해질 것입니다. 임상 분야에서는 암의 조기 진단, 치료 반응 예측, 질병 진행 모니터링, 그리고 액체 생검(liquid biopsy)을 통한 비침습적 진단 등 개인 맞춤형 의료의 핵심 기술로 자리매김할 것으로 기대됩니다. 인공지능(AI) 및 머신러닝(ML) 기술의 접목은 방대한 단일 세포 데이터의 분석 효율성을 극대화하고 새로운 생물학적 통찰력을 도출하는 데 결정적인 역할을 할 것입니다.